CodAlignView
Region Intervals + -
Trim Interval   Trim Transcript Interval
Prologue   Epilogue   Max Codons
Species Alignment Set   Ancestor
Species   Species Limit One Line Per Species
Frame Codon Position   Justify Frame   Species Codon Position
Display Wrap   Footer   Title  First AA Num  Max AA Num
Splice Site Predictions   Skip Codons Hide Inserts Hide Jumps Show Coordinates
Highlight AAs   Mark Positions
Info
Misc.
Legend
GAC No Change
GAT Synonymous
GAA Conservative
GGG Radical
TAA Ochre Stop Codon
TAG Amber Stop Codon
TGA Opal Stop Codon
ATG In-frame ATG
GA- Indel
GAC Frame-shifted
<6 Splice Prediction
() Intron
... No alignment
XXX Inferred bases
AgamP3_aa H P A D G P W R S L R F I V I L P V L I C F I C T I L S I L I I F Q I Y T
AgamP3 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AgamS1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AgamM1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AmerM1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AaraD1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AquaS1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AmelC1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AchrA1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTT CCG GTG CTT ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATA CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AepiE1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTT CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTT ATC TGT TTC ATC TGC ACG ATC CTT AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AminM1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATT CTG CCG GTG CTT ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTT AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AculA1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTT ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTT AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AfunF1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTT ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTT AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AsteS1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTT ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AsteI2 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTT ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AfarF1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATT CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AdirW1 CAT CCA GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGC TTC ATT GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTC ATC TGC ACG ATC CTC AGC ATA CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AsinS1 CAT CCG GCT GAC GGC CCG TGG AGA TCG CTC CGT TTC ATC GTA ATC CTG CCG GTA CTG ATC TGC TTT ATC TGC ACT ATC CTG AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AatrE1 CAT CCG GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG TTC CGT TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATC TGC TTT ATC TGC ACC ATC CTG AGC ATC CTG ATC ATT TTC CAG ATC TAC ACA
AdarC2 CAT CCG GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG TTC CGA TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTC ATT TGC TTT ATT TGC ACC ATC CTT AGC ATT CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
AalbS1 CAT CCG GCC GAC GGC CCG TGG AGA TCG TTC CGA TTC ATC GTC ATC CTG CCG GTG CTT ATT TGC TTT ATC TGC ACC ATC CTC AGC ATC CTG ATC ATC TTC CAG ATC TAC ACA
Introns ()