CodAlignView
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa M A D S N G T I T V E E L K K L L E Q W N L V I G F L F L T
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus ATG GCA GAT TCC AAC GGT------------------ ACT ATT ACC GTT GAA GAG CTT AAA AAG CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTT ACA
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 ATG GCA GAT --- AAC GGT------------------ ACT ATT ACC GTT GAA GAG CTG AAA AAG CTC CTT GAA CAG TGG AAT CTA GTA ATA GGA TTC CTA TTT CTT ACA
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 ATG TCA GGT GAC AAC GGT------------------ ACC ATT ACC GTT GAA GAG CTT AAA AAG CTC TTA GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGA TTC TTG TTT CTT ACA
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 ATG TCA GGT GAC AAC GGT------------------ ACC ATT ACC GTT GAA GAG CTT AAA AAG CTC TTA GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGA TTC TTG TTT CTT ACA
NC_004718_SARS_coronavirus ATC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACC GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 GTC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTC GCC
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTC AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 ATC ATG GCT GAG AAT GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTC GCC
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 ATC ATG GCG GAG AAT GGG------------------ ACC ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTT TTC CTC GCC
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTT TTC CTC GCC
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 GTC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTT GCC
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTC GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTT TTC CTC GCC
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTT TTC CTC GCC
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTC AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C GTC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTC GCC
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 GTC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTC GCC
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 GTC ATG GCT GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTT TTC CTC GCC
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A ATC ATG GCT GAG AAC GGG------------------ ACT ATT TCC GTT GAG GAG CTC AAA AGG CTC TTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTT GCC
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 ATC ATG GCA GAG AAC GGG------------------ ACA ATT TCC GTT GAG GAG CTG AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAT CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTT GCC
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C GTC ATG GCA GAG AAC GGG------------------ ACA ATC TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTT GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTC TTC CTC GCC
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 GTC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTT TTC CTC GCC
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 ATC ATG GCT GAC TAT GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAA GAG CTT AAG CAG CTC TTG GAA CAA TGG AAC CTA TTA ATA GGA TTC CTT TTC CTC CCC
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 GTC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAA GAG CTT AAG CAG CTC TTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGA TTC CTT TTC CTT GCC
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 ATC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACT ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC CTA TTC CTA GCC
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 ATC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACC ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAT CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTA GCC
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 ATC ATG ACA GAC AAC GGT------------------ ACA ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAT CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTT GCC
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 ATC ATG GCT GAG AAC GGA------------------ ACC ATT TCT GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGC TTC CTC TTC CTC GCC
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 ATC ATG GCT GAG AAC GGA------------------ ACC ATT TCT GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGC TTC CTC TTC CTC GCC
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 ATC ATG GCT GAG AAC GGA------------------ ACC ATT TCT GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGC TTC CTC TTC CTC GCC
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 ATC ATG GCT GAG AAC GGA------------------ ACC ATT TCT GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGC TTC CTT TTC CTC GCC
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 ATC ATG GCT GAG AAC GGA------------------ ACC ATT TCT GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGC TTC CTT TTC CTC GCC
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 ATC ATG GCA GAG AAC GGG------------------ ACC ATT TCC GTT GAG GAG TTG AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAC CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTT GCC
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 ATC ATG GCA GAG AAC GGG------------------ ACA ATT TCC GTT GAG GAG CTT AAA AGA CTC CTG GAA CAA TGG AAT CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTT GCC
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 ATC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACA ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAT CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTT GCT
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 ATC ATG GCA GAC AAC GGT------------------ ACA ATT ACT GTT GAG GAG CTT AAA CAA CTC CTG GAA CAA TGG AAT CTA GTA ATA GGT TTC ATT TTC CTT GCT
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 ATC ATG GCT GAG AAT GAC------------------ ACA ATT ACT GTC GAT CAG CTC AAA CAT TTA CTT GAG CAA TGG AAC CTA GTT ATA GGT TTC CTG TTC TTT GCT
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 TCT ATG ACT AAC AGT AGTGCTTCTCCTCCTACGGAG ACC ATT ACC GTA GAG CAG TTA AAA CAC CTA CTT GAG CAA TGG AAC CTA GTT ATA GGT TTT CTG TTT TTC GCT

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa W I C L L Q F A Y A N R N R F L Y I I K L I F L W L L W P V
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus TGG ATT TGT CTT CTA CAA TTT GCC TAT GCC AAC AGG AAT AGG TTT TTG TAT ATA ATT AAG TTA ATT TTC CTC TGG CTG TTA TGG CCA GTA
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 TGG ATT TGT CTT CTA CAA TTT GCC TAT GCC AAC AGG AAT AGG TTT TTG TAT ATA ATT AAG TTA ATT TTC CTC TGG CTG CTT TGG CCA GTA
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 TGG ATT TGT TTG TTA CAA TTT GCC TAT GCC AAC AGG AAT AGG TTT TTG TAC ATA ATT AAG TTA ATT TTC CTC TGG CTG CTT TGG CCA GTA
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 TGG ATT TGT TTG TTA CAA TTT GCC TAT GCC AAC AGG AAT AGG TTT TTG TAC ATA ATT AAG TTA ATT TTC CTC TGG CTG CTT TGG CCA GTA
NC_004718_SARS_coronavirus TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC GTA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 TGG ATT ATG CTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 TGG ATT ATG CTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTG TGG CTC TTG TGG CCA GTA
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 TGG ATT ATG CTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCC AAC AGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCG GTA
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C TGG ATT ATG CTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATT AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 TGG ATT ATG CTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTA TGG CCA GTA
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 TGG ATT ATG CTA CTA CAA TTT GCC TAC TCT AAT AGG AAT AGG TTT TTG CAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 TGG ATT ATG TTA CTA CAA TTT GCC TAT TCT AAC AGG AAT AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTT CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 TGG ATT ATG TTA TTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG TTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 TGG ATT ATG CTA TTA CAG TTT GCC TAT TCC AAC CGG AAC AGG TTT CTG TAT ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 TGG ATT ATG CTA CTA CAG TTT GCC TAT TCC AAC CGG AAC AGG TTT CTG TAC ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTT TTA TGG CCA GTA
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 TGG ATT ATG TTA TTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG CTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTC TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 TGG ATT ATG TTA TTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG CTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTC TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 TGG ATT ATG TTA TTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG CTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTC TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 TGG ATT ATG TTA TTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG CTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTC TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 TGG ATT ATG TTA TTA CAA TTT GCC TAT TCT AAT CGG AAC AGG CTT TTG TAC ATA ATA AAG CTT GTC TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 TGG ATT ATG CTG CTA CAG TTT GCC TAT TCT AAC CGG AAC AGG TTT CTG TAT ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTT TTG TGG CCA GTA
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 TGG ATT ATG TTA CTA CAG TTT GCC TAT TCC AAC CGG AAC AGG TTT CTG TAT ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 TGG ATT ATG TTA CTA CAG TTT GCC TAT TCC AAC CGG AAC AGG TTT CTG TAT ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 TGG ATT ATG TTA CTA CAG TTT GCC TAT TCC AAC CGG AAC AGG TTT CTG TAT ATA ATA AAG CTT GTT TTC CTC TGG CTC TTG TGG CCA GTA
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 TGG ATA TTA CTG CTT CAA TTT GCT TAT TCC AAC AGG AAC AGG TTT CTC TAC ATA ATA AAG CTA GTG TTT TTA TGG CTG TTA TGG CCT ATT
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 TGG ATT CTG CTA CTA CAG TTT GCT TAC TCC AAC AGG AAC AGG TTT CTT TAC ATA ATA AAG CTT GTG TTT CTC TGG CTT CTT TGG CCA ATT

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa T L A C F V L A A V Y R I N W I T G G I A I A M A C L V G L
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus ACT TTA GCT TGT TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATA AAT TGG ATC ACC GGT GGA ATT GCT ATC GCA ATG GCT TGT CTT GTA GGC TTG
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 ACT TTA GCC TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATA AAT TGG ATC ACT GGA GGA ATC GCT ATC GCA ATG GCT TGT CTT GTA GGC TTG
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 ACT TTA GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATA AAC TGG ATC ACT GGT GGA ATT GCC ATT GCA ATG GCC TGT CTT GTA GGC TTG
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 ACT TTA GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATA AAC TGG ATC ACT GGT GGA ATT GCC ATT GCA ATG GCC TGT CTT GTA GGC TTG
NC_004718_SARS_coronavirus ACA CTT GCT TGT TTT GTG CTT GCT GCT GTC TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATC GTA GGC TTG
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGT GGG ATT GCG ATC GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCA ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATC ATA GGC TTG
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATC AAT TGG GTG ACT GGT GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATC GTA GGC TTG
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATC AAT TGG GTG ACT GGT GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 ACA CTT GCT TGT TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATC AAC TGG GTG ACC GGT GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTG GGC TTG
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C ACA CTC GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATC AAT TGG GTG ACT GGC GGT ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAT AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATC GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGG ATT GCA ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG TTG ACT GGC GGG ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATT GTA GGC TTG
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATC AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGT ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGC ATC GTA GGC TTG
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGT ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGC ATC GTA GGC TTG
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGT ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGC ATC GTA GGC TTG
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGT ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGC ATC GTA GGC TTG
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGT ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGC ATC GTA GGC TTG
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAC TGG GTG ACC GGT GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 ACA CTT GCT TGC TTT GTG CTT GCT GCT GTT TAC AGA ATT AAT TGG GTG ACT GGC GGA ATT GCG ATT GCA ATG GCT TGT ATA GTA GGC TTG
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 ACG CTT GCC TGC TTT GTG CTC GCT GCT GTT TAT AGA ATA AAC TGG GCC ACG GGC GGC ATC GCT ATT GCA ATG GCC TGT TTA GTG GGG CTT
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 ACA CTA GCC TGC TTT GTG CTT GCT GCC GTC TAC AGA ATT AAC TGG GTT ACA GGA GGC ATA GCT ATA GCG ATG GCC TGC ATT GTG GGT CTC

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa M W L S Y F I A S F R L F A R T R S M W S F N P E T N I L L
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus ATG TGG CTC AGC TAC TTC ATT GCT TCT TTC AGA CTG TTT GCG CGT ACG CGT TCC ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACT AAC ATT CTT CTC
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 ATG TGG CTG AGC TAC TTC ATT GCT TCT TTC AGG CTA TTT GCA CGT ACG CGT TCC ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACT AAC ATT TTG CTC
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACG CGT TCC ATG TGG TCA TTT AAC CCA GAA ACT AAC ATT CTT TTG
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACG CGT TCC ATG TGG TCA TTT AAC CCA GAA ACT AAC ATT CTT TTG
NC_004718_SARS_coronavirus ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCC TTC AGG CTA TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAT ATT CTT CTC
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCC TTC AGG CTA TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCC TTC AGG CTA TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCC TTC AGG CTA TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAT ATT CTT CTC
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCC TTC AGG CTA TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTC GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAT ATT CTT CTC
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCC TTC AGG CTA TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTT AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAT ATC CTT CTC
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCC TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAC ATA CTT CTC
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCG TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCG CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACC AAC ATT CTT CTC
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 ATG TGG CTT AGC TAC TTC ATT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCA CGC ACC CGT TCT ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACT AAC ATT CTT CTC
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA AGG TGG TCG TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTC CTC
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 ATG TGG CTT AGC TAC TTC TTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 ATG TGG CTT AGC TAC TTT GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 ATG TGG CTT AGC TAC TTT GTT GCT TCC TTC AGG CTG TTT GCT CGT ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCG CGC ACC CGC TCG ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAC ATT CTT CTC
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAT ATT CTT CTC
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 ATG TGG CTT AGC TAC TTC GTT GCT TCT TTC AGG CTG TTT GCT CGC ACC CGC TCA ATG TGG TCA TTC AAT CCA GAA ACA AAT ATT CTT CTC
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 ATG TGG CTT AGC TAC TTT GTT GCA TCA TTC AGG CTT TTT GCA CGC ACT AGG TCT TGG TGG TCG TTC AAC CCA GAA ACA AAC ATC TTG CTG
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 ATG TGG CTT AGC TAC TTT GTG GCT TCA TTC AGG CTT TTC GCA CGG ACC AGG TCT TGG TGG TCT TTT AAC CCA GAA ACC AAC ATT TTG CTT

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa N V P L H G T I L T R P L L E S E L V I G A V I L R G H L R
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus AAC GTG CCA CTC CAT GGC ACT ATT CTG ACC AGA CCG CTT CTA GAA AGT GAA CTC GTA ATC GGA GCT GTG ATC CTT CGT GGA CAT CTT CGT
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 AAC GTG CCA CTC CAT GGC ACT ATT TTG ACC AGA CCG CTT CTA GAG AGT GAA CTT GTA ATC GGA GCT GTC ATC CTT CGT GGA CAT CTT CGT
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 AAC GTG CCT CTT CAT GGC ACA ATT CTG ACC AGG CCG CTT CTA GAG AGT GAA CTC GTA ATT GGA GCT GTG ATC CTT CGT GGA CAT CTT CGT
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 AAC GTG CCT CTT CAT GGC ACA ATT CTG ACC AGG CCG CTT CTA GAG AGT GAA CTC GTA ATT GGA GCT GTG ATC CTT CGT GGA CAT CTT CGT
NC_004718_SARS_coronavirus AAT GTG CCT CTC CGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGC
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 AAT GTG CCT CTC AGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGC
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGC
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 AAT GTG CCT CTC CGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGC
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 AAT GTG CCT CTG CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC CTG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC CTG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 AAT GTG CCT CTC AGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGC
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C AAT GTG CCT CTC CGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC CTG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 AAT GTG CCT CTC AGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATA GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC CTG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATA GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT CTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGA GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT TTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGC GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGG
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 AAT GTG CCT CTT CGA GGA ACA ATT TTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 AAT GTG CCT CTT CGG GGA ACA ATC TTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTG CGA
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT GTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 AAC GTG CCT CTC CGA GGT ACA ATT TTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAT TTG CGA
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 AAT GTG CCT CTC CGA GGG ACA ATT TTG ACC AGA CCG CTC TTG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTA CGA
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTA ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTG CGA
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTA ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTG CGA
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTA ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTG CGA
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTA ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTG CGA
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 AAT GTG CCT CTT CGA GGG ACA ATT GTA ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGC GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTG CGA
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT TTG ACC AGA CCG CTC TTG GAA AGT GAA CTT GTC ATC GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGA
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT CTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAT TTG CGG
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT CTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGG
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 AAT GTG CCT CTT CGG GGG ACA ATT CTG ACC AGA CCG CTC ATG GAA AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC TTG CGG
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 AAT GTG CCA CTG CGT GGC TCT ATT ATA ACC AGA CCG CTT CTG GAG AGT GAA TTA GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT TAC TTA CGT
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 AAC GTG CCA CTA CGT GGT ACC ATT CTG ACC AGA CCG CTT CTT GAG AGT GAA CTT GTC ATT GGT GCT GTG ATC ATT CGT GGT CAC CTC CGT

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa I A G H H L G R C D I K D L P K E I T V A T S R T L S Y Y K
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus ATT GCT GGA CAC CAT CTA GGA CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCT AAA GAA ATC ACT GTT GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 ATT GCT GGA CAC CAT CTA GGA CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCC AAA GAA ATC ACT GTT GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 ATT GCA GGA CAC CAT CTG GGA CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCC AAA GAA ATC ACT GTA GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 ATT GCA GGA CAC CAT CTG GGA CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCC AAA GAA ATC ACT GTA GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
NC_004718_SARS_coronavirus ATG GCC GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCG AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAT AAA
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 ATG GCA GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACC GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 ATG GCT GGA CAC TCC CTC GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCT AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 ATG GCT GGA CAC TCC CTC GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCT AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGC GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 ATG GCT GGA CAC TCT CTT GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCT AAG GAG ATC ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAT ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 ATG GCT GGA CAC TCT CTA GGG CGC TGT GAC ATC AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 ATG GCT GGA CAC TCC CTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 ATG GCT GGA CAC TCC TTA GGG CGC TGT GAT ATT AAG GAC CTG CCA AAG GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAT ATT AAG GAC CTG CCA AAG GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAT ATT AAG GAC CTG CCA AAG GAG ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAT ATT AAG GAC CTG CCA AAG GAG ATC ACT GTG GCT ACG TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAT ATT AAG GAC CTG CCA AAG GAG ATC ACT GTG GCT ACG TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAT CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 ATG GCT GGA CAC TCC CTA GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGG CGC TGT GAC ATA AAG GAC CTG CCA AAA GAG ATT ACG GTG GCT ACA TCA CGA ACG CTT TCT TAT TAC AAA
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 ATG GCT GGA CAC TCA TTG GGG CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTG CCT AAG GAA ATC ACT GTG GCT ACA TCA CGA ACT CTA TCT TAT TAC AGA
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 ATG GCT GGA CAC TCC CTT GGA CGC TGT GAC ATT AAG GAC CTC CCT AAA GAA ATC ACT GTT GCT ACA TCA CGA ACT CTA TCT TAT TAC AGA

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa L G A S Q R V A G D S G F A A Y S R Y R I G N Y K L N T D H
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus TTG GGA GCT TCG CAG CGT GTA GCA GGT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AGT CGC TAC AGG ATT GGC AAC TAT AAA TTA AAC ACA GAC CAT
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 TTG GGA GCT TCA CAG CGT GTA GCA GGT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AGT CGC TAC AGG ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAT
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 TTG GGA GCT TCG CAG CGT GTA GCA GGT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AGT CGC TAC AGG ATT GGT AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAT
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 TTG GGA GCT TCG CAG CGT GTA GCA GGT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AGT CGC TAC AGG ATT GGT AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAT
NC_004718_SARS_coronavirus TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAT AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ATT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 TTA GGA GCA TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 TTA GGA GCT TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAT AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA AGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC ACC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D TTA GGA GCG TCG CAG -GT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAT CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGA AAC TAT AAA CTA AAT ACG GAC CAT
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACC GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA CTA AAC ACA GAC CAC
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGA AAC TAC AAA CTA AAT ACA GAC CAT
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 TTA GGA GCT TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 TTA GGA GCT TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAC TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGA AAC TAT AAA TTA AAT ACA GAC CAC
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 TTA GGA GCT TCG CAG CGT GTA GGC AAC GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGG AAC TAT AAA TTA AAT ACA GAC CAC
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 TTA GGA GCT TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAT TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 CTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGT ATT GGA AAC TAC AAA TTA AAC ACA GAC CAC
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 CTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGG AAC TAC AAA TTA AAT ACT GAC CAC
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGC ATT GGA AAC TAC AAA CTA AAT ACA GAC CAT
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGA AAC TAC AAA CTA AAT ACA GAC CAT
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 TTA GGA GCG TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GCA TAC AAC CGC TAC CGA ATT GGA AAC TAC AAA CTA AAT ACA GAC CAT
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 TTA GGA GCT TCG CAG CGT GTA GGC ACT GAT TCA GGT TTT GCT GTT TAC CAC CGC TAC CGT ATT GGT AAT TAT AAA TTA AAT ACT GAC CAT
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 TTA GGA GCC TCC CAG CGT GTA GCA TCT GAT TCA GGT TTT GCT GTT TAC CAC CGC TAT CGT ATC GGT AAT TAC AAG CTA AAT ACC GAC CAC

NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus_aa S S S S D N I A L L V Q *
NC_045512_Wuhan_seafood_market_pneumonia_virus TCC AGT AGC AGT GAC AAT ATT GCT TTG CTT GTA CAG TAA
MN996532_Bat_coronavirus_RaTG13 TCC AGT AGC AGT GAC AAT ATT GCT TTG CTT GTA CAG TAA
MG772933_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZC45 TCC AGT AGC AGT GAC AAT ATT GCT TTG CTT GTA CAG TAA
MG772934_Bat_SARS_like_coronavirus_CoVZXC21 TCC AGT AGC AGT GAC AAT ATT GCT TTG CTT GTA CAG TAA
NC_004718_SARS_coronavirus GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KT444582_SARS_like_coronavirus_WIV16 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417146_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4231 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
MK211376_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018B GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417151_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs7327 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417152_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs9401 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417144_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4084 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KF367457_Bat_SARS_like_coronavirus_WIV1 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_coronavirus_F46 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417145_Bat_SARS_like_coronavirus_Rf4092 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY770858_Bat_coronavirus_Anlong_103 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417143_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4081 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417149_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4255 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
MK211378_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018D GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
MK211377_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018C GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417142_Bat_SARS_like_coronavirus_As6526 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417147_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4237 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY417148_Bat_SARS_like_coronavirus_Rs4247 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
MK211375_Coronavirus_BtRs_BetaCoV_YN2018A GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
DQ071615_Bat_SARS_coronavirus_Rp3 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KP886808_Bat_SARS_like_coronavirus_YNLF_31C GCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KF569996_Rhinolophus_affinis_coronavirus_LYRa11 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
JX993988_Bat_coronavirus_Cp_Yunnan2011 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG TTA GTA CAG TAA
MK211374_Coronavirus_BtRl_BetaCoV_SC2018 GCC GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
DQ412043_Bat_SARS_coronavirus_Rm1 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY938558_Bat_coronavirus_strain_16BO133 TCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
DQ412042_Bat_SARS_coronavirus_Rf1 TCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
DQ648856_Bat_coronavirus_BtCoV_273_2005 TCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 TCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY770860_Bat_coronavirus_Jiyuan_84 TCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
JX993987_Bat_coronavirus_Rp_Shaanxi2011 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
GQ153542_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_7 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
DQ022305_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_1 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
GQ153547_Bat_SARS_coronavirus_HKU3_12 TCA GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA
KY352407_SARS_related_coronavirus_strain_BtKY72 TCT GGT AGC AAC GAC AAT ATT GCA TTG CTA GTA CAG TAA
NC_014470_Bat_coronavirus_BM48_31_BGR_2008 ATA GGC AGT GAC GAC AAT ATT GCT TTG CTA GTA CAG TAA

membrane_glycoprotein