CodAlignView
NC_045512_SARS_CoV_2_Wuhan_Hu_1_aa M D L F M R I F T I G T V T L K Q G E I K D A T P S D F V R A T A T I P I Q A S L P F G W L I V G V A L L A V F Q S A S K I I T L K K R W Q L A L S K G V H F V C N L L L L F V T V Y S H L L L V A A G L E A P F L Y L Y A L V Y F L Q S I N F V R I I M R L W L C W K C R S K N P L L Y D A N Y F L C W H T N C Y D Y C I P Y N S V T S S I V I T S G D G T T S P I S E H D Y Q I G G Y T E K W E S G V K D C V V L H S Y F T S D Y Y Q L Y S T Q L S T D T G V E H V T F F I Y N K I V D E P E E H V Q I H T I D G S S G V V N P V M E P I Y D E P T T T T S V P L *
NC_045512_SARS_CoV_2_Wuhan_Hu_1 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATC TTC ACA ATT GGA ACT GTA ACT TTG AAG CAA GGT GAA ATC AAG GAT GCT ACT CCT TCA GAT TTT GTT CGC GCT ACT GCA ACG ATA CCG ATA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT ATT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT TCC AAA ATC ATA ACC CTC AAA AAG AGA TGG CAA CTA GCA CTC TCC AAG GGT GTT CAC TTT GTT TGC AAC TTG CTG TTG TTG TTT GTA ACA GTT TAC TCA CAC CTT TTG CTC GTT GCT GCT GGC CTT GAA GCC CCT TTT CTC TAT CTT TAT GCT TTA GTC TAC TTC TTG CAG AGT ATA AAC TTT GTA AGA ATA ATA ATG AGG CTT TGG CTT TGC TGG AAA TGC CGT TCC AAA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAT TTT CTT TGC TGG CAT ACT AAT TGT TAC GAC TAT TGT ATA CCT TAC AAT AGT GTA ACT TCT TCA ATT GTC ATT ACT TCA GGT GAT GGC ACA ACA AGT CCT ATT TCT GAA CAT GAC TAC CAG ATT GGT GGT TAT ACT GAA AAA TGG GAA TCT GGA GTA AAA GAC TGT GTT GTA TTA CAC AGT TAC TTC ACT TCA GAC TAT TAC CAG CTG TAC TCA ACT CAA TTG AGT ACA GAC ACT GGT GTT GAA CAT GTT ACC TTC TTC ATC TAC AAT AAA ATT GTT GAT GAG CCT GAA GAA CAT GTC CAA ATT CAC ACA ATC GAC GGT TCA TCC GGA GTT GTT AAT CCA GTA ATG GAA CCA ATT TAT GAT GAA CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MN996532_Bat_CoV_RaTG13 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTC ACA CTT GGA ACT GTA ACT TTG AAA CAA GGT GAA ATT AAG GAT GCT ACT CCT TCA GAT TCT GTT CGC GCT ACT GCA ACG ATA CCG ATA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT ATT GTT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAG ATC ATA ACC CTT AAA AAG AGA TGG CAA CTA GCA CTC TCT AAG GGT ATT CAC TTT ATT TGC AAC TTG CTG CTG CTG TTT GTA ACA GTT TAC TCA CAT CTT TTG CTC GTT GCT GCT GGT CTT GAA GCC CCA TTC CTC TAC CTC TAC GCT TTA GTC TAC TTC TTG CAG AGT ATA AAC TTT GTA AGA ATA ATA ATG AGG CTT TGG CTT TGC TGG AAA TGC CGT TCC AAA AAC CCA TTA CTC TAT GAT GCT AAC TAC TTC CTT TGT TGG CAT ACT AAT TGT TAT GAC TAT TGT ATA CCT TAC AAT AGT GTA ACT TCT TCA ATT GTC ATT ACT TCA GGT GAT GGC ACA ACA AGT CCT ATT TCT GAA CAT GAC TAC CAG ATT GGT GGT TAT ACT GAA AAA TGG GAG TCT GGA GTA AAA GAC TGT GTT GTA TTA CAC AGT TAC TTC ACT TCA GAT TAT TAC CAG CTG TAC TCA ACT CAA TTG AGC ACA GAC ACT GGT GTT GAA CAT GTT ACC TTC TTC ATC TAC AAT AAA ATT GTT GAT GAG CCT GAA GAA CAT GTC CAA ATT CAC ACA ATC GAC GGT TCA TCC GGA GTT GTT AAT CCA GCA ATG GAA CCA ATT TAT GAT GAA CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MG772933_Bat_SARS_like_CoV_bat_SL_CoVZC45 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTC ACT CTT GGA ACT GTT ACT CTT AAA CAA GGT GAA ATC AAA GGT GCT ACT CCT ACA AAT TCT GTT CGC ACT ACT GCA ACA ATA CCG ATA CAA GCC ACA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA ATT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCA AAA ATA ATT ACA CTC AAA AAG AGA TGG CAG TTA GCC CTC TCT AAA GGT GTT CAT TTT GTT TGC AAC TTG CTT CTG CTG TTT TTA ACA GTT TAT TCT CAC TTG TTG CTT CTT GCT GGT GGC TTG GAA GCC ACT TTT CTC TTT CTT TAT GCA TTA GCT TAT TGC TTG CAA ACT GTA AAT TTT GTG AGA ATA ATA ATG CGA TTC TGG TTG TGC TGG AAG TGC CGT TCC AAG AAT CCT TTA CTC TAT GAT GCC AAC TAC TTT CTT TGT TGG CAT ACT AAT TGT TAT GAC TAT TGT ATA CCA TAC AAT AGT GTA ACC TCT TCA ATT GTC ATC ACA TGT GGT GAT GGT ACT ACG AAT CCC ATT TCT GAG GAC GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAC ACG GAA AAG TGG GAG TCT GGT GTT AAG GAC TGT GTT GTA TTA CAT AGT TAT TTC ACC TCA GAT TAC TAC CAG CTG TAC TCA ACA CAA GTG AGT ACA GAC ACT GGT GTT GAA CAT GTT ACT TTC TTC ATC TAC AAT AAA ATT GTT GAT GAG CCT GAA GAA CAT GTT CAA ATT CAC ACA ATC GAC GGT ACA TCT GGA GTT GTT AAT CCA GCA ATG GAA CCA ATT TAT GAT GAA CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MG772934_Bat_SARS_like_CoV_bat_SL_CoVZXC21 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTC ACA CTT GGA ACT GTA AGT CTG AAA CAA GGT GAA ATT AAG GAT GCT ACT CCT TCA GAT TCT ATT CGC GCT ACT GCA ACA ATA CCG ATA CAA GCC ACA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA ATT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCA AAA ATA ATT ACA CTC AAA AAG AGA TGG CAG TTA GCC CTC TCT AAA GGT GTC CAC TTT GTT TGC AAC TTG CTT CTG CTG TTT TTA ACA GTT TAC TCA CAC CTA TTG CTT GTT GCT GGT GGC TTA GAA GCC ACT TTT CTT TTT CTT TAT GCA TTA GCT TAT TGC TTG CAA ACT GTA AAT TTT GTG AGA ATA ATA ATG CGA TTC TGG TTG TGC TGG AAG TGC CGC TCC AAG AAT CCT GTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT CTT TGT TGG CAT ACT AAT TGT TAT GAC TAT TGT ATA CCA TAC AAT AGT GTA ACC TCT TCA ATC GTC ATC ACA TGT GGT GAT GGT ACT ACG AAT CCC ATT TCT GAG GAT GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAC ACG GAA AAG TGG GAG TCT GGT GTT AAG GAC TGT GTT GTA TTA CAT AGT TAT TTC ACC TCA GAC TAC TAC CAG CTG TAC TCA ACA CAA TTG AGC ACA GAC ACT GGT GTT GAA CAT GTT ACT TTC TTC ATC TAC AAT AAA ATT GTT GAT GAG CCT GAA GAA CAT GTC CAA ATT CAC ACA ATC GAC GGT ACA TCT GGA GTT GTT AAT CCA GCA ATG GAA CCA ATT TAT GAT GAA CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
NC_004718_SARS_CoV ATG GAT TTG TTT ATG AGA TTT TTT ACT CTT AGA TCA ATT ACT GCA CAG CCA GTA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT GCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCA GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATT ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GAA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT AGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GCT AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KT444582_SARS_like_CoV_WIV16 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAG CCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT TCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCA GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCG TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417146_Bat_SARS_like_CoV_Rs4231 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAG TCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAG GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GTT ACC AAA ATA ATT GCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCG GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTC TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CAG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MK211376_CoV_BtRs_BetaCoV_YN2018B ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAG TCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA GGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAG GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT GCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT ATT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCG GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGT AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTC GTA CAT GGC TAT TTC ACT GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417151_Bat_SARS_like_CoV_Rs7327 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAG CCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCA CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT GCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA TTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCA GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTA ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTC GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GCA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417152_Bat_SARS_like_CoV_Rs9401 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAT CCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCA CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT GCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA TTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCA GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTA ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417144_Bat_SARS_like_CoV_Rs4084 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAG CCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT TCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCA GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KF367457_Bat_SARS_like_CoV_WIV1 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA CCA ATT ACT GCA CAG CCA GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT TCG CTC AAT AAA AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT GTT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCA GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCG TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCT ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KU973692_UNVERIFIED_SARS_related_CoV_F46 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA TCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT ACT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAG GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTC CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAT AGG TGG CAG CTT GCC CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG ACA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT GTG ATT TAC ATT CTA CAA GTT GTA AGC TTC TGT AGA CTT ATC ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AGA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAC AAC CAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACG GAT ACA ATT GTC ATC ACT GCA GGT GAT GGC ATT TCA AGG CCA AAA CTT CAT GAA GAC TAC CAA ATA GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAC TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAG ATT ACT ACT GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTC AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GTA ATG GAC CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417145_Bat_SARS_like_CoV_Rf4092 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCG ATC ACG CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTC CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTT ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT GTT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAC AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGC ATC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGC GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA ATT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCG ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KJ473816_BtRs_BetaCoV_YN2013 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCG ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTC CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT GTT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAC AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGC GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GCT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GCA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY770858_Bat_CoV_Anlong_103 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT CTT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC GCC CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTC CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAC GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A TCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ATG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417143_Bat_SARS_like_CoV_Rs4081 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTT GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGA TGG CAG CTC GCT TTG TAT AAA GGC ATG CAG CTT GTT TGC AAT CTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAC CTC TTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG TGC TTC TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTC TAT GAT GTC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417149_Bat_SARS_like_CoV_Rs4255 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGC TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC AGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC GCT CTG TAC AAA GGC ATT CAG CTT GTG TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTA ACA ATT TAC TCG CAC CTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GCT GTC AGT TTT TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCT AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAT ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MK211378_CoV_BtRs_BetaCoV_YN2018D ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGC TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA GGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAG GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATT GCG CTC AAT AAA AAA TGG CAG CTA GCC CTT TAT AAG GGC TTC CAG TTC ATT TGC AAT TTA CTG CTG CTA TTT ATT ACC ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTC GCT GCG GGT ATG GAG GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTA CAA TGC ATC AAC GCA TGT AGA ATT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGT AAA TCC AAG AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAC ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG AAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTC GTA CAT GGC TAT TTC ACT GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
FJ588686_Bat_SARS_CoV_Rs672_2006 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTC GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT CTT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC GCC CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTA CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT ATT ATG AGG TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTT CAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAT TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAC CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ATG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MK211377_CoV_BtRs_BetaCoV_YN2018C ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGC TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC AGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG TTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC GCT CTG CAC AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTA ACA ATT TAC TCA CAC CTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT GTT CTG CAA GCT GTC AGC TTT TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGT TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA ATA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTC GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417142_Bat_SARS_like_CoV_As6526 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTC CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CTA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT GTT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGT AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTC TAT GAC GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417147_Bat_SARS_like_CoV_Rs4237 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG TTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC GCT ATG TAC AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTA ACA ATT TAC TCA CAC CTT TTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GCT GTG AGC TTC TGC AGA TTT ATC ATG AGA TGT TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTC TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY417148_Bat_SARS_like_CoV_Rs4247 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGA TGG CAG CTC GCT TTG TGT AAA GGC ATG CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAC CTC TTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG TGC TTC TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTC TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MK211375_CoV_BtRs_BetaCoV_YN2018A ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC CTG TAT AAA GGC ATC CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAC CTC CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT GTT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGC AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGC GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA GTT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
DQ071615_Bat_SARS_CoV_Rp3 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTC ACA TTA GGA GCA ATC ACA CGT CAA CCA GCC AAA ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAG GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAG GTG ATT GCG CTA CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC TTG CAT AAA GGC ATT CAG CTT GTA TGC AAT CTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTT CTA CTG TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT CTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAT ATT CTG CAA ATC GTA AGT TTT TGT AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTT TAT GAT GCT AAC TAC TTT GTA TGT TGG CAC ACC AAT TGC TTT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT ATC ACT GAC ACA ATC GTC CTC ACC TCA GGT GAC GGA ACT ACC CAA CCA AAA CTT AAG GAA GAT TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTA AAA GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGT TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG TTG GAA TCG ACA CAA CTG TCG ACT GAT ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --A GAT CAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KP886808_Bat_SARS_like_CoV_YNLF_31C ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATT ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CTT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA TTC TCT TTC CGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC TTA TAC AAA GGC ACC CAA TTT GTT TGT AAC TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAT CTT TTA CTC TTA GCT GCT GGC ATG GAG GTA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT ATT CTG CAA ATC TTA AAC TTT TGC AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAT CCA TTA CTA TAC GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA TAT AAT TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA AAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA GAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACT GAA GTT CAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT AGT ACA GAC ACA GGT ATT CAA AAT GCT ACA TTC TTT ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAC GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KJ473815_BtRs_BetaCoV_GX2013 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGC TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC ACA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT TCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTA ATT GCG CTT CAC ACA AGG TGG CAA CTC GCC TTA TAT AAA GGC GTT CAA TTT GTT TGT AAT TTG CTG CTG CTC TTC GTT ACA ATC TAC TCA CAC CTT TTA TTG CTA GCT GCT GGC ATG GAA GTA CAA TTC TTG TAC ATC TAT GCC CTT ATT TAC ATC CTG CAA ATT GTA AGT TTT TGT AGA TTT GTC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTT TAT GAT GCT AAC TAT TTT GTA TGT TGG CAC ACT AAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC GGT GTC ACA GAT ACA GTT GTC ATC ACC TCA GGT GAT GGA ATA AAT GAG CCA AAA CTA AAA GAA GAC TAT CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAT TAC CAG CTT GAA TCG ACT CAA TTG TCG ACT GAT ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --A GAT CAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCG GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KF569996_Rhinolophus_affinis_CoV_LYRa11 ATG GAT TTG TTT ATG AGA ATT TTT ACT CTT GGA TCA ATT ACT GCA CAA CCG GGA AAA ATT GAC AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG TTA CAA GCC ACA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAG AGC GCT ACC AAA ATA ATC GCG CTC AAT AAG AGA TGG CAG CTA GCC CTT TAC AAG GGT TTC CAG TTC ATT TGT AAT CTG CTG CTG CTA TTT GTT ACA ATC TAT TCA CAT CTT TTG CTT GTT GCT GCA GGT ATG GAA GCG CAA TTT TTG TAC CTC TAT GCC TTG ATA TAT TTT CTG CAA TGC ATC AAT GCG TGC AGA ATT ATC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAG AAT CCA TTA CTT TAT GAT GCT AAC TAC TTT GTT TGT TGG CAT ACC AAT TGT TAT GAC TAC TGT ATA CCT TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC CTC ACA TCC AGT GAC GGA ACA AAT GTG CCA AAA CTA AAG GAA GAC TAC CAA ATA GGT GGT TAT TCT GAA GAC TGG CAC TCA GGT GTG AAA GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGT TAT TTC ACT GAA ATC TAC TAC CAG CTC GAA TCG ACT CAA TTG TCG ACA GAC ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAA CTT GTT AAA GAT GC- --A GAT CAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAC GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
JX993988_Bat_CoV_Cp_Yunnan2011 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATC ACT CGT CAA CCA GGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGT GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC GCT CTG TAT AAA GGC ATT CAG CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTA ACA ATT TAC TCA CAC CTT CTA CTC TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TCG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTC AGC TTC TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTT TAT GAT GTC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAC AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAT AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATA GTC GTC ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGC GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACT GAA GTT TAT TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATA GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
MK211374_CoV_BtRl_BetaCoV_SC2018 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACG CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCG AGT AAG ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC AGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT TTT GCT GTT CTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTC AAC CTG TAT AAA GGC TTT CAT CTT GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTT TTT GTG ACG ATT TAC TCA CAT CTT CTA CTT TTG GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT CTG ATT TAT ATT CTG CAA GTT GTG AGC TTC TGC AGA TTT ATT ATG AGA TGC TGG CTT TGC TGG AAG TGC AAA TCC AAA AAC CCA TTA CTC TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA CAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATT GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA AAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT GCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --A CCG AAT GTG CAA TTA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KJ473814_BtRs_BetaCoV_HuB2013 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTC ACA TTG GGA GCA ATC ACA CGC CAA CCA GCG AAA ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC TTG TAT AAA GGC ATT CAG TTT GTT TGC AAC CTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAT CTT CTA CTG TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAC ATT CTG CAA ATC CTA AGC TTT TGC AGA TTC ATC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCG TTG CTC TAT GAT GCT AAC TAC TTT GTA TGT TGG CAC ACC AAT TGC TTT GAT TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT ATC ACT GAC ACA ATT GTC CTC ACG TCA GGT GAT GGA ACT ACT CAG CCA AAA CTA AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCC GAG TAT TGG CAT TCA GGT GTA AAG GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGT TAT TTC ACT GAA ATC TAC TAC CAG TTA GAA TCG ACA CAA CTA TCG ACT GAC ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --G GAC CAT GTA CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GTA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
DQ412043_Bat_SARS_CoV_Rm1 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTC ACA TTG GGA GCA ATC ACA CGC CAA CCA GCG AAA GTT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAG CTT GCC TTG TAT AAA GGC ATT CAG TTT GTT TGC AAT CTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAT CTT CTA CTG TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAC ATT CTG CAA ATC GTA AGC TTC TGC AGA TTT ATC ATG AGG TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTC TAT GAT GCT AAC TAT TTC GTA TGT TGG CAC ACC AAT TGC TTT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT ATC ACT GAC ACA ATT GTC CTC ACG TCA GGT GAC GGA ACT ACT CAG CCA AAA CTT AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCC GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTA AAG GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGT TAT TTC ACT GAA ATC TAC TAC CAG TTA GAA TCG ACA CAA CTA TCG ACC GAC ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --G GAC CAT GTA CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY938558_Bat_CoV_strain_16BO133 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CTT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA TTC TCT TTC CGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAG GTA ATT GCG CTT CAT AAG AAG TGG CAG CTT GCC TTA AAC AAA GGC TTT CAA TTA GTT TGT AAC TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAT TTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATT GAG GTG CAA TTC TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT ATT CTG CAA ACT TTA AGC TTT TGC AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTC TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAT CCA TTA TTA TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA TAT AAT TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT GCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA GAA GTC AAA GAA TAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC GCC GAA GTT CAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT CAA AAC GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GAT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAC CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
DQ412042_Bat_SARS_CoV_Rf1 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CTT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA TTC TCT TTC CGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTA ATT GCG CTT CAT AAG AAG TGG CAG CTT GCC TTA TAC AAA GGC ATC CAA TTA GTT TGT AAC TTG CTG CTA CTT TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAT TTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATT GAG GTA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT ATT CTG CAA ATT TTA AGC TTT TGC AGA TTT GTC ATG AGA TGC TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAT CCA TTA TTA TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA TAT AAT TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT TCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA GAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT CAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT CAA AAC GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAG GAT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAC CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
DQ648856_Bat_CoV_BtCoV_273_2005 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATC ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CTT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA TTC TCT TTC CGA TGG CTT GTT ATT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTA ATT GCG CTT CAT AAG AAG TGG CAG CTT GCC TTA TAC AAA GGC ATC CAA TTA GTT TGT AAC TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAT TTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATT GAG GTA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT ATT CTG CAA ATT TTA AGC TTT TGC AGA TTT GTC ATG AGA TGC TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAT CCA TTA TTA TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA TAT AAT TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT TCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA GAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAC TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT CAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT CAA AAC GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAG GAT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAC CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KJ473812_BtRf_BetaCoV_HeB2013 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATT ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CTT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC TCT TTC CGA TGG CTT GTT GCT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AGG TGG CAA CTT GCC TTA CAC AAA GGC ATC CAA TTT GTT TGC AAC TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAT CTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GTA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT ATT CTG CAA ACT TTA AGT TTT TGC AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAT CCA TTA TTA TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA TAT AAT TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT TCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA GAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT CAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT CAA AAC GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GGT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAC CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY770860_Bat_CoV_Jiyuan_84 ATG GAT TTG TTT ATG AGT ATT TTC ACA CTT GGA TCA ATT ACA CGT CAA CCA AGT AAG ATT GAA AAT GCT TTT CTT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC TCT TTC CGA TGG CTT GTT GCT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTT CAT AAG AAG TGG CAA CTT GCC TTA CAC AAA GGC ATC CAA TTT GTT TGC AAC TTG CTG CTA CTC TTT GTG ACA ATT TAT TCA CAT CTT CTA CTT TTA GCT GCT GGC ATG GAG GTA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCT TTG ATT TAT ATT CTG CAA ACT TTA AGT TTT TGC AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTT TGT TGG AAG TGC AAA TCC AAG AAT CCA TTA TTA TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTT TGC TGG CAT ACA TAT AAT TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA ATC GTC GTT ACT TCA GGT GAC GGC ATT TCA ACA CCA GAA CTC AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTC GTT GTA CAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT CAC TAC CAG CTT GAG TCT ACA CAA ATT ACT ACA GAC ACT GGT ATT CAA AAC GCT ACA TTC TTC ATC TTT AAC AAG CTT GTT AAA GGT CC- --G CCG AAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAC CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
JX993987_Bat_CoV_Rp_Shaanxi2011 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTC ACA CTA GGA GCA ATC ACA CGC CAA CCA GCG AAA ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACA GCA ACG ATA CCG CTA CAA GCC TCA CTC CCA TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTG ATT GCG CTC CAT AAG AGA TGG CAG CTT GCC TTG TAC AAA GGC ATT CAA CTC GTT TGC AAT TTG CTG CTA CTC TTT GTC ACA ATT TAT TCA CAC CTA TTA CTG TTA GCT GCT GGC ATG GAG GCA CAA TTT TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAC ATT CTG CAA ATC GTA AGT TTT TGC AGA TTC ATC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTC TAT GAT GCC AAC TAC TTT GTA TGT TGG CAC ACG AAT TGC TTT GAT TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT ATC ACT GAC ACT ATT GTC CTC ACC TCA GGT GAT GGA ACA AAT CAG CCA AAA CTT AAA GAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT ATT AAA GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGC TAC TTT ACT GAA GTC TAT TAC CAG TTG GAA ACG ACA CAA TTG TCG CCT GAA ACT GGT GTT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TTT AGC AAA CTT GTT AAA GCT GT- --A GAC CAT GTA CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCT GGA GTT ATA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATC TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
GQ153542_Bat_SARS_CoV_HKU3_7 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTT ACA TTG GGA GCA ATC ACG CGC AAT CCA GCG AAA ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCG CTG CAA GCC ACA CTC CCC TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCC AAA GTA ATT GCG CTT CAT AGA AGG TGG CAA CTC GCC TTA TAT AAA GGC GTT CAA TTT GTA TGT AAT TTG CTG CTG CTC TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTT TTA TTG CTA GCT GCC GGC ATG GAA GCA CAA TTC TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAC ATT CTG CAA ATT GCA AGT TTT TGT AGA TTT GTC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTT TAT GAT GCT AAC TAT TTT GTA TGT TGG CAC ACT AAT AAC TAT GAT TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA GTT GTC ATC ACC TCA GGT GAT GGA ACA AAT CAG CCA AAA CTA AAA GAA GAC TAT CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTA GTA ATA CAT GGC TAT TCC ACC GAA GTT TAT TAC CAG CTT GAA TCG ACT CAA TTG TCG ACT GAG ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --A GAT CAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
DQ022305_Bat_SARS_CoV_HKU3_1 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTC ACA TTG GGA GCA ATC ACG CGC AAT CCA GCG AAA ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCA CTA CAA GCC ACA TTC CCT TTC GGA TGG CTT ATT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCT AAA GTA ATT GCG CTT CAT AGA AGG TGG CAG CTC GCC TTA TAT AAA GGC GTT CAA CTT GTA TGT AAT ATG CTG CTG CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTT CTA CTT CTA GCT GCT TGC ATG GAA GCA CAA TTC TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAT ATC TTG CAA ATT GTA AGT TTT TGT AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTC TAT GAT GCT AAC TAT TTT GTA TGT TGG CAT ACT AAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA GTT GTC ATC ACC TCA GGT GAT GGA ACA AAT CAG CCA AAA CTA AAA GAA GAC TAT CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTA GTA ATA TAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAT TAC CAG CTT GAA TCG ACT CAA TTG TCG ACT GAT ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --A GAT CAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
GQ153547_Bat_SARS_CoV_HKU3_12 ATG GAT TTG TTT ATG AGC ATT TTC ACA TTG GGA GCA ATC ACG CGC AAT CCA GCG AAA ATT GAA AAT GCT TCT CCT GCA AGT ACT GTT CAT GCT ACT GCA ACG ATA CCA CTA CAA GCC ACA TTC CCT TTC GGA TGG CTT ATT GTT GGC GTT GCA CTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT TCT AAA GTA ATT GCG CTT CAT AGA AGG TGG CAG CTC GCC TTA TAT AAA GGC GTT CAA CTT GTA TGT AAT ATG CTG CTG CTT TTT GTG ACA ATT TAC TCA CAC CTT CTA CTT CTA GCT GCT GGC ATG GAA GCA CAA TTC TTG TAC ATC TAT GCC CTG ATT TAT ATC TTG CAA ATT GTA AGT TTT TGT AGA TTT ATC ATG AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAG TGC AGA TCC AAA AAT CCA TTA CTC TAT GAT GCT AAC TAT TTT GTA TGT TGG CAT ACT AAT AAC TAT GAC TAC TGT ATA CCA TAC AAC AGT GTC ACA GAT ACA GTT GTC ATC ACC TCA GGT GAT GGA ACA AAT CAG CCA AAA CTA AAA GAA GAC TAT CAA ATT GGT GGT TAT TCT GAG GAT TGG CAT TCA GGT GTT AAA GAC TAT GTA GTA ATA TAT GGC TAT TTC ACC GAA GTT TAT TAC CAG CTT GAA TCG ACT CAA TTG TCG ACT GAT ACT GGT GCT GAA AAT GCT ACA TTC TTC ATC TAT AGC AAG CTT GTT AAA GAT GT- --A GAT CAT GTG CAA ATA CAC ACA ATC GAC GGC TCT TCA GGA GTT GTA AAT CCA GCA ATG GAT CCA ATT TAT GAT GAG CCG ACG ACG ACT ACT AGC GTG CCT TTG TAA
KY352407_SARS_related_CoV_strain_BtKY72 ATG GAT TTG TTT ATT AGC ATT TTC ACA TTA GGT TCA ATC ACT CGT --- --- GGT AGT GTG CAA AAT GCT GTT CCT GCA AAT TCT CTT CAT GCT ACG GCT ACC ATC CCT TTA CAA GCC ACT CTG CCT TTC GGA TGG CTT ATT GTT GGC GTT GCA TTG CTT GCT GTT TTT CAA AAT GCT TCA AAA GTA ATT CCT TTT AAC AGC TTG TGG CAG CGC TGC CTT TAT CAA AGC TTC CAA CTT GTT TGC AGT CTG TTA GTT GGT TTT CTC ACA GTC TAT GTA CAC CTA TTG CTG GCA GCT GCT GGG CTA GAA GCC CCA TTT CTT TAT CTT TTA GCC CTA ATC TAC TTC TTA CAG TGT GTT GTT TTT GGT AGG TTT TTA TTA AGG TGT TGG CTT TGC TGG AAA TGC AAG TCC AAG AAC CCT CTT ATT TAT GAT GCC TCC TAC TTT GTT TGT TGG CAT ACA CAC ACT CAT GAC TAT TGT ATT CCG TAC AAT AGT ATT ACT GAA ACC ATA GTC CTC ACT GCA GGA GAT GGT GTA ACT ATT CCT ATA AAA ACA CAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TTT GTA GAA AAA TGG GAG TCT GGT GTC AAG GAC TAT GTT ACA CTC ATA GGC CTT TTC ACT GAA ATA CAT TAC CAG TTG GAA TCT ACT CAA ATT TCA GCT GAC ACT GGT ATT AAC AAC GCG ACG TTT TTC CTT TTC TCT AAA TAT GAT AGA GAA AG- --T GAG AGC GTC CAA GTT CAC ACA ATC GAC GGC TCA TCA GGA GTT GTA AAT --- --- --- --- CCA ATT TAT GAT GAG CCA ACG CCG ACT ACT AGC GTG CCT CTC TAA
NC_014470_Bat_CoV_BM48_31_BGR_2008 ATG GAT TTG TTT TTG AAC ATC TTC ACT TTA GGA TCT ATT ACT AGA CAA CCT GGT AAA GTT GAA AAT GTT TCT CCT GCA AGT TCT TTT CAT TCT ACA GCG TCC ATC CCT TTA CAG GCC ACT CTA CCT TTC GGA TGG CTT GTT GTT GGC GTT GCA TTT CTT GCT GTT TTT CAA AGC GCT GCG AAA TTA ATA CCT TTT AAC AGT CTT TGG CAG CGT TGC TTA TAC CAG AGC TTT CAA TTG CTT TGC AAT GTG CTT CTT ATT GCT TTG ACA GTT TAC TCG CAC TTA CTG CTT GTT GCT GCA GGG CTT GAA GCA CCT TTC CTT TAT CTA CTT GCT TTG ATT TAC TTC TTA CAG TGC GTT GTA TTT GGC AGG CTT CTT GTC AGA TGC TGG CTG TGC TGG AAA TGC AAA TCA AAG AAT CCA TTA ATT TAT GAC TCA AAC TAT TTT GTT TGC TGG CAT ACT CAC ACT CAT GAC TAT TGT ATT CCT TAC AAT AGC ATT ACA AAC ACT ATC GTC CTC ACT GCA GGT GAT GGT GTC ACT ATT CCC ATT CGG ACA CAA GAC TAC CAA ATT GGT GGT TAC TTC GAA AAA TGG GAA TCT GGT GTT AAG GAC TAT CTT ACA CTT ATT GGT CCT TTC ACT GAA GTT TAT TAC CAG CTT GAA TCT ACC CAG ATT TCC ACA GAC ACT GGT ATT AAT AAT GCG ACA TTC TTC CTC TTC TCA AAG AAT GAT GAA AGA GAA CAG GAA AGT GTC CAA GTT CAC ACA ATC GAC GGC TCA TCA GGA GTT GTA AAC --- --- --- --- CCA ATT TAC GAT GAG CCG ACG CCG ACT ACT AGC GTG CCT CTT TAA

ORF3a_protein