chromosome start end total_cn major_cn minor_cn star 1 10001 8548858 4 2 2 1 1 8548859 8629546 3 2 1 1 1 8629547 8630883 2 1 1 1 1 8630884 11858287 4 2 2 1 1 11858288 45952073 4 2 2 1 1 45952074 46766662 4 2 2 1 1 46766663 46766835 2 1 1 1 1 46766836 46865281 5 3 2 1 1 46865282 47831122 3 2 1 1 1 47831123 52451005 2 1 1 2 1 52451006 52451143 2 1 1 1 1 52451144 53234717 2 1 1 1 1 53234718 76252880 2 1 1 2 1 76252881 76279091 1 1 0 1 1 76279092 79409669 1 1 0 2 1 79409670 104680005 2 1 1 2 1 104680006 121349401 2 1 1 2 1 121349402 128899999 NA NA NA NA 1 128900000 155054161 3 2 1 1 1 155054162 155054495 2 1 1 1 1 155054496 155277362 3 2 1 1 1 155277363 155313695 2 1 1 1 1 155313696 247247500 2 1 1 2 1 247247501 249250620 2 1 1 1 2 55259 18619967 2 1 1 2 2 18619968 18640010 2 1 1 1 2 18640011 31960171 3 2 1 1 2 31960172 90499999 2 1 1 2 2 90500000 96799999 NA NA NA NA 2 96800000 185097624 2 1 1 2 2 185097625 195858801 1 1 0 1 2 195858802 196084382 1 1 0 1 2 196084383 222220964 2 1 1 2 2 222220965 242985695 3 2 1 1 3 100074 9530053 2 1 1 2 3 9530054 9531695 1 1 0 1 3 9531696 9766586 4 2 2 1 3 9766587 9767195 1 1 0 1 3 9767196 9771620 1 1 0 1 3 9771621 9794634 1 1 0 2 3 9794635 9795802 1 1 0 1 3 9795803 12762787 2 2 0 1 3 12762788 24751380 2 1 1 2 3 24751381 24753114 1 1 0 1 3 24753115 25637542 1 1 0 1 3 25637543 25659267 1 1 0 2 3 25659268 26135527 1 1 0 1 3 26135528 26139718 2 1 1 1 3 26139719 72263021 2 1 1 2 3 72263022 72840909 1 1 0 2 3 72840910 87899999 1 1 0 1 3 87900000 93899999 1 1 0 1 3 93900000 94069918 1 1 0 1 3 94069919 94070063 1 1 0 1 3 94070064 94075436 1 1 0 1 3 94075437 94075451 1 1 0 1 3 94075452 109610456 1 1 0 1 3 109610457 109614140 1 1 0 1 3 109614141 109627596 1 1 0 1 3 109627597 109906082 1 1 0 1 3 109906083 109910299 1 1 0 1 3 109910300 109917290 1 1 0 1 3 109917291 109917532 1 1 0 1 3 109917533 109921432 1 1 0 1 3 109921433 109926328 1 1 0 1 3 109926329 109949833 1 1 0 1 3 109949834 110959085 1 1 0 2 3 110959086 110995206 1 1 0 1 3 110995207 111022340 1 1 0 2 3 111022341 111595837 1 1 0 1 3 111595838 111821899 1 1 0 2 3 111821900 111827050 1 1 0 2 3 111827051 111830709 1 1 0 2 3 111830710 111833813 1 1 0 2 3 111833814 111833849 1 1 0 2 3 111833850 111856119 1 1 0 2 3 111856120 169814775 2 1 1 2 3 169814776 169814899 1 1 0 1 3 169814900 169814928 2 1 1 1 3 169814929 170068340 3 2 1 1 3 170068341 170068646 2 1 1 1 3 170068647 170187381 2 1 1 1 3 170187382 170187397 NA NA NA NA 3 170187398 171499187 2 1 1 2 3 171499188 171499244 2 1 1 1 3 171499245 171509691 3 2 1 1 3 171509692 171510023 2 1 1 1 3 171510024 174391377 2 1 1 2 3 174391378 174391616 1 1 0 1 3 174391617 178694291 1 1 0 1 3 178694292 178694325 2 1 1 1 3 178694326 187438565 3 2 1 1 3 187438566 187439070 2 1 1 1 3 187439071 187755420 2 1 1 2 3 187755421 188267752 1 1 0 2 3 188267753 197847500 2 1 1 2 4 27500 48199999 2 1 1 2 4 48200000 52699999 2 1 1 2 4 52700000 63789995 2 1 1 2 4 63789996 191154275 2 1 1 2 5 22500 44580842 2 1 1 2 5 44580843 44631112 1 1 0 1 5 44631113 45886585 1 1 0 1 5 45886586 46099999 0 0 0 1 5 46100000 50699999 NA NA NA NA 5 50700000 68243591 2 1 1 2 5 68243592 89284522 2 1 1 2 5 89284523 98485012 1 1 0 1 5 98485013 98589519 0 0 0 1 5 98589520 100864959 1 1 0 1 5 100864960 135139946 2 1 1 2 5 135139947 180689978 2 1 1 2 6 39681 201975 NA NA NA NA 6 201976 57997649 2 1 1 2 6 57997650 58699999 1 1 0 1 6 58700000 63299999 1 1 0 1 6 63300000 82749910 1 1 0 1 6 82749911 93827615 2 1 1 2 6 93827616 115966036 1 1 0 1 6 115966037 170899934 2 1 1 2 7 40386 57949987 2 1 1 2 7 57949988 62082529 NA NA NA NA 7 62082530 62460063 0 0 0 1 7 62460064 158821400 2 1 1 2 8 10001 165404 NA NA NA NA 8 165405 18641926 2 1 1 2 8 18641927 18641970 2 1 1 1 8 18641971 43099999 2 1 1 2 8 43100000 48099999 NA NA NA NA 8 48100000 78431534 2 1 1 2 8 78431535 78603098 1 1 0 1 8 78603099 108584175 2 1 1 2 8 108584176 108608000 0 0 0 1 8 108608001 126163866 2 1 1 2 8 126163867 126220546 1 1 0 1 8 126220547 146364021 2 1 1 2 9 10001 153760 0 0 0 1 9 153761 47299999 2 1 1 2 9 47300000 50699999 NA NA NA NA 9 50700000 66823802 2 1 1 1 9 66823803 140273200 2 1 1 2 10 108972 37999999 3 2 1 1 10 38000000 42417191 NA NA NA NA 10 42417192 42603916 0 0 0 1 10 42603917 42845054 1 1 0 1 10 42845055 48310176 3 2 1 1 10 48310177 115339326 2 1 1 2 10 115339327 116021842 1 1 0 2 10 116021843 135389924 3 2 1 1 11 20721 190009 2 1 1 1 11 190010 48935508 2 1 1 2 11 48935509 50350021 1 1 0 1 11 50350022 50567500 0 0 0 1 11 50567501 50652301 0 0 0 2 11 50652302 51593038 0 0 0 1 11 51593039 55699999 NA NA NA NA 11 55700000 134452200 2 1 1 2 12 110107 33299999 2 1 1 2 12 33300000 38438436 NA NA NA NA 12 38438437 45025425 1 1 0 1 12 45025426 132349400 2 1 1 2 12 132349401 133851894 3 2 1 1 13 1 16299999 NA NA NA NA 13 16300000 19499999 2 1 1 2 13 19500000 24304432 3 2 1 1 13 24304433 24318754 3 2 1 1 13 24318755 24672975 3 2 1 1 13 24672976 93900251 2 1 1 2 13 93900252 99918924 2 1 1 2 13 99918925 99918952 2 1 1 1 13 99918953 105113284 2 1 1 2 13 105113285 105113583 1 1 0 1 13 105113584 105210048 1 1 0 1 13 105210049 105210529 2 1 1 1 13 105210530 114142800 2 1 1 2 13 114142801 115169877 5 3 2 1 14 1 16099999 NA NA NA NA 14 16100000 19099999 2 1 1 1 14 19100000 19352500 2 1 1 1 14 19352501 20375050 2 1 1 1 14 20375051 27879993 2 1 1 2 14 27879994 28537611 1 1 0 1 14 28537612 106368400 2 1 1 2 15 1 15799999 NA NA NA NA 15 15800000 20699999 2 1 1 1 15 20700000 42788649 3 2 1 1 15 42788650 42804106 3 2 1 1 15 42804107 43001466 4 2 2 1 15 43001467 44073002 4 2 2 1 15 44073003 44073145 2 1 1 1 15 44073146 62098216 2 1 1 2 15 62098217 100338800 3 2 1 1 15 100338801 102531391 4 2 2 1 16 94048 32517499 4 2 2 1 16 32517500 32599898 1 1 0 1 16 32599899 33869801 2 1 1 1 16 33869802 34599999 2 1 1 2 16 34600000 38599999 NA NA NA NA 16 38600000 46461743 NA NA NA NA 16 46461744 64851730 2 1 1 2 16 64851731 72752294 4 2 2 1 16 72752295 73623883 2 2 0 1 16 73623884 73979028 2 1 1 2 16 73979029 74003221 1 1 0 1 16 74003222 77948159 2 1 1 2 16 77948160 78530199 3 2 1 1 16 78530200 78531992 2 2 0 1 16 78531993 78535263 1 1 0 1 16 78535264 78595109 1 1 0 2 16 78595110 80040187 3 2 1 1 16 80040188 80069248 1 1 0 1 16 80069249 80547634 2 1 1 2 16 80547635 80593155 1 1 0 1 16 80593156 80690997 3 2 1 1 16 80690998 80691270 NA NA NA NA 16 80691271 88827200 4 2 2 1 16 88827201 90354752 6 3 3 1 17 12500 22199999 4 2 2 1 17 22200000 25799999 NA NA NA NA 17 25800000 42436540 4 2 2 1 17 42436541 43936461 4 2 2 1 17 43936462 56304804 3 2 1 1 17 56304805 78774600 4 2 2 1 17 78774601 81195209 6 3 3 1 18 27500 15385468 3 2 1 1 18 15385469 18999999 NA NA NA NA 18 19000000 71080025 2 1 1 2 18 71080026 76117000 3 2 1 1 18 76117001 78077247 4 2 2 1 19 102500 254447 2 1 1 1 19 254448 24399999 5 3 2 1 19 24400000 28599999 NA NA NA NA 19 28600000 59128982 4 2 2 1 20 29234 25599999 2 1 1 2 20 25600000 29850047 NA NA NA NA 20 29850048 62432500 4 2 2 1 21 1 9417499 NA NA NA NA 21 9417500 10670000 NA NA NA NA 21 10670001 15252080 NA NA NA NA 21 15252081 42868840 2 1 1 1 21 42868841 42869031 2 1 1 1 21 42869032 42872635 1 1 0 1 21 42872636 42872693 2 1 1 1 21 42872694 43975082 5 3 2 1 21 43975083 43981720 2 1 1 1 21 43981721 46564323 5 3 2 1 21 46564324 46565037 2 1 1 1 21 46565038 46944200 5 3 2 1 21 46944201 48129894 5 3 2 1 22 1 12199999 NA NA NA NA 22 12200000 17899999 3 2 1 1 22 17900000 19898625 5 3 2 1 22 19898626 19898927 2 1 1 1 22 19898928 48092714 4 2 2 1 22 48092715 49687500 5 3 2 1 22 49687501 51304565 6 3 3 1 X 1 58099999 1 1 0 3 X 58100000 62999999 1 1 0 1 X 63000000 155270559 1 1 0 3 Y 1 11599999 NA NA NA NA Y 11600000 13599000 NA NA NA NA Y 13599001 13885605 NA NA NA NA Y 13885606 59373565 NA NA NA NA